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1、網(wǎng)上生物醫(yī)學信息介紹,北京萬方數(shù)據(jù)股份有限公司 2002年5月 系列培訓教程（二） 張秀梅 楊春紅,1. 網(wǎng)上生物醫(yī)學文獻類型,文摘型數(shù)據(jù)庫 全文型數(shù)據(jù)庫 事實型數(shù)據(jù)庫 生物醫(yī)學專業(yè)網(wǎng)站 生物醫(yī)學整合知識平臺,2. 文摘型生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫,pubMed數(shù)據(jù)庫 TOXNET數(shù)據(jù)庫 EMBase荷蘭醫(yī)學文摘 CBMdisc中國生物醫(yī)學文獻光盤數(shù)據(jù)庫 OCLC FirstSearch檢索系統(tǒng) BA&BP美國生物學文摘 CA化學文摘 ISI Chemistry,Medline 1996今 70多國家 4500余種生物醫(yī)學期刊 43種語言 90%英文 78%有英文摘要 數(shù)據(jù)周更新 37萬條/年 Preme

2、dline 未標引記錄 Medline Publisher Supplied Citations 出 版 商 Pubmed,2.1 PubMed數(shù)據(jù)庫(1) (http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed) 免費,Mesh,標引,美國NCBI(National Center of Biological Information) 研制,截止2001年2月28日,已與1724種期刊連接.,2.1 PubMed數(shù)據(jù)庫(2),能指引檢索者使用醫(yī)學主題詞表中規(guī)范的術(shù)語進行有效檢索。MeSH(Medical Subject Headlings)由美國國立醫(yī)學圖書館編制，是對生物醫(yī)學文

3、獻進行主題分析、標引和檢索時使用的權(quán)威性詞表。它以標準的術(shù)語描述生物醫(yī)學概念，共收錄18000個主題詞，通過注釋，參照系統(tǒng)和樹狀結(jié)構(gòu)，表達了MeSH詞的歷史演變，揭示了MeSH詞間的語義關(guān)系，成為指引檢索者使用規(guī)范化生物醫(yī)學術(shù)語進行有效檢索的工具。,MeSH Browser:,2.2 TOXNET數(shù)據(jù)庫(1) (http:/www.toxnet.nlm.nih.gov),毒理學數(shù)據(jù)庫 毒理學文獻 有毒化學制品釋放系統(tǒng) 化學信息（術(shù)語、標識與結(jié)構(gòu)）,11種 事實型 書目型 DB,美國國立圖書館創(chuàng)建,2.2 TOXNET數(shù)據(jù)庫(2),表格內(nèi)容后續(xù),2.2 TOXNET數(shù)據(jù)庫(2),2.3 荷蘭醫(yī)學

4、文摘(1),Embase是荷蘭Elsevier Science B.V.出版 商建立的書目文獻數(shù)據(jù)庫. 1974年今 800多萬條 445000條/年增 70余個國家的4000多種期刊 EMBase突出藥物文獻和藥物信息40% 藥物方面副主題詞多 藥物信息字段多,1,EMBase(Excerpta Medica Database),2.3 荷蘭醫(yī)學文摘(2),2,EMBase與MEDLINE數(shù)據(jù)庫比較,1980今 千種期刊、匯編、會議論文 總1816623條 20萬條/年增 涵蓋中文科技資料目錄(醫(yī)藥衛(wèi)生) CMCC中文生物醫(yī)學期刊目次數(shù)據(jù)庫 CBMdisc的詞表 Mesh 及中醫(yī)藥學主題詞表

5、 中國分類法,2.4 中國生物醫(yī)學文獻光盤數(shù)據(jù)庫 (CBMdisc),中國醫(yī)學科學院醫(yī)學信息研究所研制,1967年創(chuàng)建 ohio州 1992年推出 FirstSearch 70多個數(shù)據(jù)庫 30多個可檢全文 7500種期刊的聯(lián)機全文 3000中期刊的電子版 900多萬篇全文,2.5 OCLC FirstSearch檢索系統(tǒng)(CBMdisc),圖書館聯(lián)機計算機中心創(chuàng)建 （Online Computer Library Center）,1926年兩刊合并生物學文摘 美生物學會聯(lián)合會負責編輯 生物學文摘公司出版 1964年BA的編輯出版機構(gòu)為“生物科學情報” （BioScience Informati

6、om Service） 簡稱BIOSIS 主任：維特BIOSIS Previes,2.6 BA&BP（1）,BA 美國生物學文摘Biologocal Abstracts 前身是美國細菌協(xié)會編輯出版社的細菌學文摘 美國植物學會植物學文摘,2.6 BA&BP（2）,包括 生物學文摘 Biological Abstracts,BA Biological Abstracts/RRM (Reports,Review,Meetings) 收錄 5500種生命科學期刊及非期刊文獻 10000條/周更新,BP Biosis Preview,周刊，2卷/年，26期/卷 150個國家 14000種科技期刊 1/4

7、與生物醫(yī)學相關(guān) 26個國家 2個國際組織的專利資料 學位論文、會議文獻、科技報告、存檔資料、圖書 56種語言 占世界化學化工文獻總量的98%,2.7 化學文摘(Chemical Abstract) “開啟化學文獻寶庫的鑰匙”,1907年創(chuàng)刊，前身美國化學研究評論 美國化學會志,2.8 ISI Chemistry,該庫收集了公布在全球核心化學期刊和國際專 利出版物上所有最新發(fā)現(xiàn)和改進的有機合成方法， 提供翔實的化學反應綜述和詳盡的試驗細節(jié)，以及 新化合物的化學結(jié)構(gòu)和相關(guān)性質(zhì)(制備與合成方法、 化學反應與生物活性),兩個子庫 化學反應中心(Reaction Center) 1840年今 60多種化

8、學反應 2萬多個專利反映 42000個/年增 化合物中心(Compound Center) 1960年今 530萬種有機化合物 20萬種/年增,3. 全文型數(shù)據(jù)庫,PML數(shù)據(jù)庫 OVID數(shù)據(jù)庫 SDOS全文檢索系統(tǒng) EBSCO數(shù)據(jù)庫 中國期刊網(wǎng),3.1 網(wǎng)上獲取醫(yī)學文獻全文的途徑,訪問免費電子期刊網(wǎng)站 http:/www.health.library.mcgill.ca/ejournal/ fulltext.htm/ http:/www.stanford.hirewire.edu/lists/freeart.dt 通過作者的Email直接索取 一些二次文獻數(shù)據(jù)庫提供原文連接服務(Pubmed)

9、 查全文數(shù)據(jù)庫 機構(gòu)代查,該公司1938年創(chuàng)建 宗旨:為圖書館、政府、院校師生提供高質(zhì)量信息 業(yè)務范圍:連續(xù)出版物、新聞報紙、圖書、學位論 文、學術(shù)性收藏品 文獻量:55億條 PML光盤版 網(wǎng)絡版,3.2 ProQuest Medical Library數(shù)據(jù)庫,PML由Bell&Howell Information and Learning (原UMI公司)出版,從MEDLINE起家,目前包括人文、社會、科技近百DB 一半為生物醫(yī)學 Ovid Web Gateway數(shù)據(jù)庫檢索 400中期刊全文 100種電子期刊，回溯至1993年 HTML，實現(xiàn)Medline、生物醫(yī)學全 文期刊和循證醫(yī)學DB之

10、間的互鏈,3.3 OVID數(shù)據(jù)庫,OVID Technologies.Inc 由Mark Nelson 1984年創(chuàng)立,SDOS 原名為EES(Elsevier Electronic Subscriptions) SDOS 系統(tǒng)提供1200多種電子期刊(包括Pergamon NorthHolland出版物)的訂閱服務 1200種電子期刊分為12類與生物醫(yī)學相關(guān)的為 Agricultural and Biological Sciences Clinical Medicine Life Science,3.4 Elsevier Science公司 SDOS全文檢索系統(tǒng),Elsevier Scien

11、ce是荷蘭一家著名的出版公司 Science Direct Onsite(SDOS)是該公司開發(fā)的系 統(tǒng),提供用戶在本地訪問其基于Web的全文電子期刊,EBSCO Publishing50多個電子文獻數(shù)據(jù)庫 近3000種期刊全文+文摘索引期刊 4000種 學術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫(Academic Search Fulltezt Elite,ASFE) 1530種期刊全文+近2700種期刊索引和文摘 其中SCI收錄的核心刊993種(含全文350種) 生物醫(yī)學期刊554種 檢索系統(tǒng) EBSCO host,3.5 EBSCO數(shù)據(jù)庫,EBSCO公司是世界上最大的提供文獻服務的專業(yè) 公司之一,國內(nèi)核心期刊

12、1994年今 全文400多萬篇 專業(yè)特色期刊 題錄1000萬余條 網(wǎng)上數(shù)據(jù)日更新 理工(3)、 農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥衛(wèi)生、文史哲、經(jīng)濟政 治與法律、教育與社科、電子技術(shù)與信息科學 9個專輯、126個數(shù)據(jù)庫，其中醫(yī)藥衛(wèi)生747種 題錄數(shù)據(jù)庫 摘要數(shù)據(jù)庫 全文數(shù)據(jù)庫 專題數(shù)據(jù)庫,3.6 中國期刊網(wǎng),清華同方光盤股份有限公司 光盤國家研究中心 共同創(chuàng)建 中國學術(shù)期刊(光盤版)電子雜志社 1999年6月起上網(wǎng),5300種,4. 事實型數(shù)據(jù)庫,分子生物數(shù)據(jù)庫 藥物三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 醫(yī)學圖譜 病理切片庫 專利信息資源,4.1 分子生物數(shù)據(jù)庫,基因序列數(shù)據(jù)庫 NCBI的GenBank 蛋白序列數(shù)據(jù)庫(Pro.aa.)

13、日內(nèi)瓦大學SwissProt (6萬余種Pro.2200個aa.) 結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫:小分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(Cambridge Structural DB) 大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(Protein DataBank,PDB) 分子疾病數(shù)據(jù)庫OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) 生物信息學算法 基于Web的信息儲存、查找與檢索 如：NCBI建立的Entrez系統(tǒng) 歐洲分子生物實驗室SRS系統(tǒng) 分子可視化,PubMed生物醫(yī)學文獻 Neccleotide核苷酸序列數(shù)據(jù)庫 Protein蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫 Structure大分子三維結(jié)構(gòu) Genome完整的基因組匯編

14、Popset以DNA和Pro.分析生物間的進化關(guān)系 Taxonomy分類學數(shù)據(jù)庫 OMIM孟德爾人類遺傳學數(shù)據(jù)庫 Books生物醫(yī)學網(wǎng)絡版書 Probeset基因表達選集 3D Domain特定功能域三維結(jié)構(gòu),4.2 Entrez系統(tǒng)包含,4.3 藥物三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,美國國立癌癥研究所藥物信息系統(tǒng)三維數(shù)據(jù)庫 (NCI Drug Information System 3D Database) 40多萬種藥物三維結(jié)構(gòu) 美國國立癌癥研究所三維數(shù)據(jù)庫(NCI3D) 126554個化合物的三維結(jié)構(gòu)信息 艾滋病藥物結(jié)構(gòu) http:/chem.sis.nlm.nih.gov/aidsdrg4.htm/ 三維

15、藥物結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(日本) 具有藥物活性的化學物質(zhì)三維結(jié)構(gòu)DB,4.4 醫(yī)學圖譜,可視人計劃(The Visible Human Project) http:/www.nlm.nih.gov/research/visible/ 1986年NLM發(fā)起 男女尸體詳盡三維精細解剖圖 CT、MRI、冷凍切片三種技術(shù) 目標：創(chuàng)造一個知識結(jié)構(gòu)體系，可以方便地實現(xiàn)將 可視的圖像知識與文本知識鏈接成一個整體 全腦圖譜(the Whole Brain Atlas) 哈佛醫(yī)學院 Keith A.Johnson 麻省理工 J.Alex Becker 將人腦正常和病理結(jié)構(gòu)圖像與臨床醫(yī)學信息整合,合作開發(fā),1900多幅病理

16、切片 http:/medstat.med.utah.edu/ WebPath/WebPath.hlm/,4.5 病理切片庫,WebPath 美 Utah大學醫(yī)學院 病理科Edward C.Klatt博士創(chuàng)建,5. 生物醫(yī)學專業(yè)網(wǎng)站介紹(1),美國國立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH) http:/www.nih.gov 健康信息(出版物、數(shù)據(jù)庫) 科研基金申請情況 美國國立醫(yī)學圖書館(National Library of Medicine,NLM) http:/www.nlm.nih.gov 健康信息 圖書館服務 Health A to Z 專業(yè)

17、搜索引擎 美國醫(yī)學會網(wǎng)站(American Medical Association) http:/www.amaassn.org,5. 生物醫(yī)學專業(yè)網(wǎng)站介紹(2),Health A to Z 搜索引擎 美國國立癌癥研究所(National Cancer Institute,NCI) http:/www.nci.nih.gov 美國疾病預防與控制中心 (Centers for Disease Control and Prevention,CDC) http:/www.cdc.gov 世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO) http:/www.who.int D

18、rug InfoNet http:/www.drugInfoN,First Data Drug Database 美國食品藥物管理局(Food and Drug Administration,FDA) http:/www.fda.gov 中國醫(yī)藥信息網(wǎng) 國家藥品監(jiān)督管理局 中國中醫(yī)藥信息網(wǎng) 國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥文獻檢索中心,5. 生物醫(yī)學專業(yè)網(wǎng)站介紹(3),6. 生物醫(yī)學整合知識平臺(1) ISI Web OF Science,ISI(Institute for Scientific Information) Web of Knowledge 是一個基于Web整合ISI Web of Science,ISI Current Contents Connect和 其他重要信息資源的新一代信息體系 以ISI Web of Science(ISI著名的三大引文索引 Science Citation Index Expanded, Social Science Citation Index, Arts & Humanities Citation Indez)為核心 交叉檢索、整合學術(shù)期刊、技術(shù)專利、會議錄、 化學反應、研究基金、Internet資源,6. 生物醫(yī)學整合知識平臺(2) ISI Web OF Science,