人類基因組DNA提取及瓊脂糖凝膠電泳分析PPT課件
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人類基因組DNA提取及瓊脂糖凝膠電泳分析,第一節(jié) 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?掌握人類基因組DNA提取的基本原理和方法,掌握瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA方法,第二節(jié) 實(shí)驗(yàn)原理,核酸提取思路:,破膜:細(xì)胞膜、核膜 分離:通過酶,有機(jī)溶劑,調(diào)節(jié)pH值,離心等純化:去除雜質(zhì),DNA提取原則:,保證DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性排除其他分子的污染,使其純度盡可能高排除有機(jī)溶劑和金屬離子的污染蛋白質(zhì)、多糖、脂類等降低到最低程度排除其他核酸分子的污染,樣品來源:,培養(yǎng)細(xì)胞組織標(biāo)本血液樣本,用細(xì)胞裂解液裂解細(xì)胞膜,收集細(xì)胞核,加入SDS破裂核膜,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并從DNA上解離下來,經(jīng)苯酚﹑氯仿抽提去除蛋白質(zhì),無水乙醇沉淀DNA,75%乙醇洗滌DNA沉淀,真空干燥后,溶解于TE中即得到高分子量的DNA。,本次實(shí)驗(yàn)使用的試劑盒系直接加入裂解液裂解細(xì)胞后,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并從DNA上解離下來,再利用特殊硅基質(zhì)膜吸附DNA的特性,可快速、高效地純化回收基因組DNA。,離心吸附柱內(nèi)的硅基質(zhì)膜在高鹽,低pH值狀態(tài)下選擇性地結(jié)合溶液中的DNA,再通過漂洗液將雜質(zhì)去除,最后低鹽,高pH值的洗脫緩沖液或去離子水將DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。,,高鹽,低pH值: 選擇性結(jié)合 DNA,,漂洗,,低鹽,高pH值: DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫,第三節(jié) 主要試劑,主要試劑,,培養(yǎng)細(xì)胞RNase A(100mg/ml)Protease Buffer GRBuffer GL無水乙醇Buffer GW1Buffer GW2Buffer GE,第四節(jié) 主要儀器,微量移液器,臺(tái)式微量離心機(jī),電泳儀,凝膠成像系統(tǒng),主要儀器,LIFE,第五節(jié) 操作步驟,1.樣品處理:取1管細(xì)胞,做好標(biāo)記,5000rpm離心3分鐘,棄上清,收集細(xì)胞。,3.向以上溶液中加入20 μl Protease K,混勻。,4.加入200 μl Buffer GL,顛倒混勻15次,劇烈震蕩至少1分鐘。注意:不要直接將Protease直接加入到Buffer GL。,5. 56℃孵育10分鐘,其間顛倒混勻數(shù)次,6.加入200 μl無水乙醇,顛倒混勻10次,劇烈震蕩。短暫離心,使管壁和壁蓋上 的液體集中到管底。,第五節(jié),操作步驟,7.將步驟5所得溶液全部加入到已裝入收集管的吸附柱中,一次不能加完溶液,可分 多次轉(zhuǎn)入。12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中廢液,吸附柱重新放回收集管中。,2.加入200μl GR,用移液器反復(fù)吸打幾次,使細(xì)胞懸浮。,14,10.吸附柱置于一個(gè)新的離心管中,向吸附柱中間部位懸空加入60μl Buffer GE, 室溫放置2分鐘,12,000 rpm離心1分鐘,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。,7.向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1,12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的 廢液,將吸附柱重新放回收集管中。,8.向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2,12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的 廢液,將吸附柱重新放回收集管中。,9.10,000 rpm離心2分鐘,倒收集管中的廢液。吸附柱置室溫2分鐘,以徹底晾干。,第五節(jié),操作步驟,11.取5 -10μl基因組DNA,并加入2 μl上樣緩沖液,混勻,加樣到1%瓊脂糖凝膠點(diǎn)樣孔中,電泳檢測分析。,15,第六節(jié) 注意事項(xiàng),(1)試劑配制及保存規(guī)范,離心管及Tip頭需經(jīng)高壓滅菌處理。,(2)基因組DNA長而彎曲,易斷裂。操作過程中盡量輕緩,避免過度的 溶液吹打轉(zhuǎn)移,以及過高的溫度。,第六節(jié),注意事項(xiàng),17,第七節(jié) 結(jié)果分析,第七節(jié),結(jié)果分析,量:越多越好。量越多電泳區(qū)帶越明亮。 質(zhì)量:a. 純度越純越好。A260/A280越接近1.8越好b. 分子量越大越好。 DNA分子量大于30KB,可滿足一般實(shí)驗(yàn)要求。1.0%的瓊脂糖凝膠電泳,理想電泳結(jié)果:靠近點(diǎn)樣孔,落后于Marker最后一條區(qū)帶(約21KB)的位置可見一條明亮的區(qū)帶。區(qū)帶前方,不應(yīng)有拖尾(降解),或較彌散的小分子量區(qū)帶(RNA)。,19,M: λDNA/HindIII+EcoRI DNA Marker; 1-5: 基因組DNA 基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果圖,第七節(jié),結(jié)果分析,LIFE,20,課程相關(guān)資源,課程簡介,課程簡介,《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》----國家精品資源共享課,2013 (http://202.197.64.71:4505/),《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》----國家精品課程(本科),2008 ( http://netclass.csu.edu.cn/jpkc2008),生命科學(xué)學(xué)院資源共享平臺(tái)( http://life.csu.edu.cn),,,,,,,,,,,,,,謝謝!,xiongdehui@csu.edu.cn,0731-8480 5449,,- 1.請仔細(xì)閱讀文檔,確保文檔完整性,對于不預(yù)覽、不比對內(nèi)容而直接下載帶來的問題本站不予受理。
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